【1/12&1/20開催】Fastq から vcf 生成を超高速で:新しい QIAGEN CLC LightSpeed モジュール (英語、適宜日本語でのサマリー有)

DATE: 20230120    DURATION: 01:00:00    PRESENTED BY: Leif Schauser, Director, Global Product Management - QIAGEN CLC Products, QIAGEN Digital Insights

新しい QIAGEN CLC LightSpeed モジュールは、革新的なアルゴリズムとデータ構造により、ヒト全ゲノムシークエンスデータから変異コールを超高速で実施します。イルミナや類似のシーケンサー(Paired end 150bp X2) の 40X ヒト全ゲノムシーケンス NGS データから、ハードウェアアクセラレーション(GPU)なしで、30分未満で vcf ファイルを生成することを可能にしました。この革新的なCLC LightSpeed モジュールは、通常の新しいコンピュータであれば、実行可能です。まずは、遺伝性の変異コール用のパイプライン (リードマッピング、変異コール) スピード、CPU、メモリ消費、汎用される他システムと比較した多くの性能的ベンチマークの結果について解説する予定である。

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